Komposti tyhjennetään keväällä tai syksyllä, jolloin puutarhassa on eniten käyttöä kompostimullalle. Täyttynyt kompostori voidaan tyhjentää myös kesken kauden, koska massa tarvitsee happea kompostoitumisen jatkumiseksi.
Kompostoitumaton massa eli katekomposti siirretään takaisin siemeneksi seuraavalle kompostille. Valmis kompostimulta käytetään sellaisenaan kateaineena tai ravinnelisänä pensaille ja maanparannusaineena nurmikolle. Se voidaan myös jalostaa pidemmälle jälkikompostoimalla sitä kasassa peitteen alla tai lautakehikossa 6–12 kuukautta.
Kompostimullan käyttö riippuu kasvista. Kurkun sukuiset kasvit kestävät hyvin tuoretta, vahvaa kompostimultaa, kun taas sipulikasvit vaativat kasvumullalta pitkän jälkikompostointiajan. Kompostimultaa voi käyttää hiekkaan sekoitettuna myös kukkaruukuissa.